Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCR4P51679 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms