Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRIM1P49642 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRIM1P49642 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms