Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD97P48960 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD97P48960 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD97P48960 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms