Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATRXP46100 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms