Protein–RNA interactions for Protein: P43358

MAGEA4, Melanoma-associated antigen 4, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA4P43358 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MAGEA4P43358 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms