Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC1A2P43004 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC1A2P43004 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms