Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LIPAP38571 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LIPAP38571 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms