Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPARGP37231 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms