Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGM1P36871 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGM1P36871 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGM1P36871 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGM1P36871 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGM1P36871 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGM1P36871 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms