Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHI3L1P36222 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHI3L1P36222 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms