Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CTNNB1P35222 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms