Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
APOBEC3AP31941 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
APOBEC3AP31941 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms