Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXA10P31260 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms