Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HLA-FP30511 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms