Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ECHS1P30084 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms