Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARID4AP29374 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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