Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GJB2P29033 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GJB2P29033 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms