Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMBRP28336 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms