Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSFA2P28290 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SSFA2P28290 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms