Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VARSP26640 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VARSP26640 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VARSP26640 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VARSP26640 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms