Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PRKCHP24723 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKCHP24723 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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