Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA6P23229 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA6P23229 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms