Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XPAP23025 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XPAP23025 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XPAP23025 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XPAP23025 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XPAP23025 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XPAP23025 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XPAP23025 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XPAP23025 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XPAP23025 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
XPAP23025 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XPAP23025 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
XPAP23025 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XPAP23025 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms