Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRKACBP22694 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms