Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RCC1P18754 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RCC1P18754 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms