Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 OSTCP1-202ENST00000522287 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXB1P14653 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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