Protein–RNA interactions for Protein: P14209

CD99, CD99 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99P14209 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD99P14209 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD99P14209 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD99P14209 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD99P14209 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD99P14209 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD99P14209 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD99P14209 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD99P14209 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD99P14209 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD99P14209 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD99P14209 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD99P14209 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD99P14209 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD99P14209 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD99P14209 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms