Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms