Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PRG2P13727 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PRG2P13727 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PRG2P13727 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PRG2P13727 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms