Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RLBP1P12271 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RLBP1P12271 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms