Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCL3P10147 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCL3P10147 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL3P10147 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms