Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM10L1P0DMW3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms