Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRPRAP08240 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRPRAP08240 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms