Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HSP90AB1P08238 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSP90AB1P08238 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms