Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APODP05090 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APODP05090 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APODP05090 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APODP05090 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APODP05090 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APODP05090 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APODP05090 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
APODP05090 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APODP05090 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APODP05090 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APODP05090 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APODP05090 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APODP05090 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms