Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRB1P04280 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRB1P04280 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB1P04280 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB1P04280 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRB1P04280 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms