Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KDM4AO75164 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KDM4AO75164 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms