Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP4O75161 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP4O75161 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms