Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SPAG9O60271 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
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