Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PROM1O43490 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PROM1O43490 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PROM1O43490 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PROM1O43490 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms