Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HTRA2O43464 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms