Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTIFO43310 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTIFO43310 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTIFO43310 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTIFO43310 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTIFO43310 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms