Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPHP1O15259 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms