Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPATO15228 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPATO15228 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GNPATO15228 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GNPATO15228 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPATO15228 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms