Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD28O15084 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms