Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CASKO14936 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CASKO14936 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CASKO14936 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms