Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOC4-APOC2K7ER74 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms