Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H7C1D1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H7C1D1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H7C1D1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H7C1D1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms