Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms