Protein–RNA interactions for Protein: E5RI56

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E5RI56 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
E5RI56 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E5RI56 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
E5RI56 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E5RI56 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E5RI56 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
E5RI56 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
E5RI56 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
E5RI56 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E5RI56 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms